2024年4月15日 · Desmond: An MD simulation software package that runs on certain commodity GPUs. We make Desmond available at no cost for use by faculty members, researchers, and/or students at academic and not-for-profit institutions.

Desmond is a GPU-powered high-performance molecular dynamics (MD) engine for simulating biological systems such as small protein, viral capsids, protein-ligand complexes, small molecules in mixed solvents, organic solids, and synthetic macromolecular complexes.

Desmond is a given name and a surname, derived from the Irish place-name Desmond, an anglicization of the Irish Deas-Mhumhna ("South Munster"). [1] The Irish peerages of Ormonde , Desmond , and Thomond represented the old sub-kingdoms of East, South, and North Munster, respectively. [ 2 ]

2021年3月6日 · 前往 D E Shaw，D. E. Shaw Research Desmond Registration，完成注册， 下载Desmond 学术版，我下载的版本文 2021.1 版本，Desmond_Maestro_2021.1.tar.gz. 接下来，你可以，

2024年6月1日 · 所谓分子动力学模拟 （MD，Molecular dynamic）是指把蛋白质和 小分子 的每个原子都看作是具有牛顿力学的质点，赋予其一个随机初速度，然后就任其按照牛顿力学的互作来自由运动，这可最大程度上允许实验者模拟蛋白质和小分子在细胞中的真实存在状态。. 分子动力学模拟可定义水分子，或者类似 ...

2022年12月6日 · Desmond模拟是在一个单一的图形处理器（GPU）上运行。 如果主机有一个以上的GPU，作业驱动会自动选择GPU。 一个模拟只能选择一个GPU，因为多于一个GPU的扩展性很差。

2021年7月19日 · 1，2 已经描述了生物大分子动力学模拟得基本概念和如何下载安装Desmond。本文来看如何准备输入文件。

2022年12月9日 · Desmond模拟的结构输入是一个Desmond复合模型系统，其中包括结构（坐标和连接）和力场。 该结构包括溶质和溶剂，并可能包括膜、反离子和盐。 本章描述了用于构建输入复合模型系统和创建自定义溶剂以输入系统构建器的命令语法：

Desmond is a GPU-powered high-performance molecular dynamics (MD) engine for predicting bulk properties of materials, such as thermophysical properties, elastic constants, stress/strain relationships, diffusion coefficients, viscosity, persistence length, free energy of …

Desmond Ang is an applied economist and assistant professor at the Harvard Kennedy School of Government. His research examines the causes and consequences of racial discrimination and has been published in leading journals including American Economic Review, American Political Science Review, and Quarterly Journal of Economics.Desmond received his PhD in …